Các phòng chức năng
– Phòng tổ chức – Hành
– Phòng Kế hoạch – Nghiệp vụ
– Phòng Tài chính – Kế toán
Các khoa chuyên môn
– Khoa Phòng, chống bệnh truyền nhiễm
– Khoa Phòng, chống HIV/AIDS
– Khoa Phòng, chống bệnh không lây nhiễm
– Khoa Dinh dưỡng
– Khoa Sức khoẻ môi trường – Y tế trường học – Bệnh nghề nghiệp
– Khoa Sức khoẻ sinh sản
– Khoa Truyền thông – Giáo dục sức khoẻ
– Khoa Ký sinh trùng – Côn trùng
– Khoa Kiểm dịch y tế quốc tế
– Khoa Dược – Vật tư y tế
– Khoa Xét nghiệm – Chẩn đoán hình ảnh – Thăm dò chức năng
– Phòng khám đa khoa, chuyên khoa
